I bcaa, direttamente, non possono provocare effetti da "eccesso proteico", in quanto vengono assorbiti direttamente nello stomaco e baipassano tutto il resto dell'apparato digerente.
Al limite possono aversi effetti indiretti, in quanto l'assunzione di bcaa diminuisce il fabbisogno proteico, per cui bisogna controllare l'assunzione di proteine con la normale alimentazione. Si presuppone, ad ogni modo, che l'integrazione serva appunto per "integrare"; quindi si dà per presupposta una situazione che necessita di aumentato fabbisogno proteico; quindi, teoricamente, situazioni del genere non dovrebbero verificarsi.