Senza aver letto tutta la discussione per me la risposta ai tuoi problemi è tutta in quei 3 cm .Ci avevo anche pensato, ma, vorrebbe dire stravolgere la bici, in quanto pedalavo circa 3cm più basso del dovuto....
Poi francamente, non penso proprio sia quello il problema, vuoi per la reputazione del biomeccanico, vuoi perchè altrimenti, avrei avuto problemi ad entrambe le ginocchia probabilmente.